A. 明視野顯微鏡:這就是前面所提到的普通顯微鏡，它是顯微鏡中十分基本、普遍的類型。其它各種類型的特種顯微鏡都是由它演變而來的。原理也是在明視野顯微鏡的基礎(chǔ)上附加或更換特殊的附件就可以變?yōu)槠渌@微鏡啦。
B. 暗視野顯微鏡:這種顯微鏡利用特殊的集光器使照明光線不能直接進入物鏡，只有標本表面的散射光進入物鏡，因此整個視野的背景是暗的。用這種顯微鏡能夠觀察到明視野顯微鏡所無法分辨的微小顆粒（ 0.1-x-0.015m ），因此暗視野顯微鏡多用于微生物和膠體微粒的觀察。
C. :這是一種利用一定波長的光使標本的特異性物質(zhì)受到激發(fā)而發(fā)射熒光，通過觀察熒光研究標本的特異性物質(zhì)成分或標本的特異結(jié)構(gòu)的顯微鏡。這種顯微鏡具有特殊的照明系統(tǒng)、熒光垂直照明器以及暗視野集光器。
其次如果根據(jù)像的形成技術(shù)將顯微鏡進行分類的話，也可以分為以下幾種。
A. 相差顯微鏡：這是一種使光波通過樣品時波長與振幅發(fā)生變化，以增大物體的明暗反差，用來觀察未染色的活體細胞和組織細微結(jié)構(gòu)的顯微鏡。這種顯微鏡具有特殊的相差集光器和相差物鏡。
B. 干涉相差顯微鏡:這種顯微鏡使通過標本的光線和通過標本之外的光線發(fā)生干涉并把光的相位變化變?yōu)檎穹兓?，從而可以觀察染色或未染色物體的細微結(jié)構(gòu)并能測定標本中干物質(zhì)的含量。
C. 偏光顯微鏡:這是一種利用偏振光原理來觀察具有雙折射特性物質(zhì)的顯微鏡。這種顯微鏡多用于礦物學(xué)和巖石學(xué)，在生物學(xué)和醫(yī)學(xué)中可用于觀察和研究具雙折射特性的纖維蛋白、淀粉粒、紡捶絲等結(jié)構(gòu)。
外觀展示：
除此之外，我們還可以根據(jù)鏡體構(gòu)造來將顯微鏡進行劃分：
A. 倒置顯微鏡:這是一種把照明系統(tǒng)置于載物臺上面，把物鏡置于載物臺下面的顯微鏡。這種顯微鏡由于大大加長了物臺上放置樣品的高度，可以放置培養(yǎng)器皿。因此多用于觀察培養(yǎng)的活體細胞和組織。
B. 體視顯微鏡:這是一種利用落射光照明觀察物體的外部形態(tài)和立體結(jié)構(gòu)的顯微鏡。這種顯微鏡放大倍數(shù)較低，一般為60-500 x。但它的應(yīng)用范圍非常廣泛，可用于工農(nóng)業(yè)生產(chǎn)及科學(xué)文化事業(yè)的許多領(lǐng)域。
C. 比較顯微鏡:這實際上是一種合并在一個鏡架上的兩臺顯微鏡，但是它可以把兩個標本的像借助于棱鏡組合在一個目鏡的兩半視野內(nèi)，用以比較兩個標本的結(jié)構(gòu)和染色。
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