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為評價超分辨率圖像的質(zhì)量,我們采用分塊傅里葉環(huán)相關(guān)(FRC)分辨率映射的方法檢測了MCF-7細胞膜上Cy3連接的小分子肽或抗體的分辨率。計算FRC時,將圖像分塊,每一塊代表不同的分辨率(圖a)。統(tǒng)計了5次實驗的10幅圖像的最小分辨率,得到小分子肽標(biāo)記圖像的平均最小分辨率為32.1 nm,抗體標(biāo)記為33.3 nm,結(jié)果非常相似,這兩種探針之間沒有顯著性差異(圖b),這是由于不同的標(biāo)記分子連接相同的染料導(dǎo)致的。雖然這兩種探針獲得的分辨率相似,但由于抗體的大尺寸和多個結(jié)合位點,標(biāo)記效率可能不同,這反映在飽和濃度、標(biāo)記密度和特異性識別方面。我們首先通過計算細胞膜上的定位密度來測量肽和抗體的飽和標(biāo)記濃度。兩種標(biāo)記物的定位密度曲線均先隨濃度的增加而增大,并最終保持穩(wěn)定。通過比較摩爾濃度,小分子肽染色在0.64 μM濃度下,為1225 ± 140 μm-2個定位點,抗體在0.034 μM處達到1100 ± 117個定位點。此外,在兩種標(biāo)記的蛋白質(zhì)簇存在差異,用SR-Tesseler方法,對膜蛋白簇進行了分析,結(jié)果表明,肽比抗體識別的EpCAM簇面積要小,識別的簇個數(shù)要多于抗體(圖4-5d和4-5e),表明肽具有更強、更準(zhǔn)確的蛋白簇識別能力。
如圖——小分子肽和抗體對細胞膜上EpCAM的識別。(a)分別用Cy3結(jié)合的肽和抗體標(biāo)記EpCAM,傳統(tǒng)的圖像、相應(yīng)的dSTORM圖像和的FRC圖。標(biāo)尺,5 μm。(b)FRC分辨率的比較。(c?e)小分子肽和抗體標(biāo)記的EpCAM的定量分析:每平方微米的定位數(shù)(c)、簇個數(shù)(d)和平均簇面積(e)。