為了進(jìn)一步探索和驗(yàn)證Trop2簇在原代細(xì)胞上的分布特征,我們選擇人原發(fā)性肺腺癌細(xì)胞作為NSCLC的代表,配對(duì)原代正常肺上皮細(xì)胞作為對(duì)照
跨膜糖蛋白Trop2與許多上皮癌有關(guān)。它不僅在促進(jìn)胎兒肺生長(zhǎng)方面發(fā)揮作用,還參與腫瘤發(fā)生、惡性轉(zhuǎn)化和腫瘤播散。然而,Trop2在分子水平上的詳細(xì)分布仍然未知。本文使用直接隨機(jī)光學(xué)重建揭示了Trop2在培養(yǎng)和原代肺癌細(xì)胞和正常細(xì)胞膜上的空間組織。所有類型的癌細(xì)胞都比正常細(xì)胞呈現(xiàn)更多的Trop2定位。通過(guò)SR-Teseller聚類分析,我們發(fā)現(xiàn)Trop2以簇的形式存在于所有膜上;然而,癌細(xì)胞產(chǎn)生的簇比正常細(xì)胞更多,由更多的分子組成。本研究結(jié)果揭示了膜Trop2的異質(zhì)分布,突出了肺癌細(xì)胞與正常細(xì)胞之間膜Trop2聚集特征的顯著差異,為進(jìn)一步研究Trop2聚集在肺癌中的機(jī)制和功能奠定了基礎(chǔ)。
研究結(jié)果(節(jié)選)
1.Trop2在不同培養(yǎng)細(xì)胞上的高分辨率成像
NSCLC主要包含三種類型,每種類型中選擇一種細(xì)胞作為代表:A549代表ADC,sk-MES-1代表SqCC,H460代表LCC。由于NSCLC是異質(zhì)性原發(fā)性支氣管上皮腫瘤,我們選擇HBE細(xì)胞作為對(duì)照組。圖像顯示Trop2散射在所有細(xì)胞膜上,其中一些形成熒光斑點(diǎn),但無(wú)法清晰區(qū)分(圖1a-d)。然而,重建的dSTORM圖像顯著提高了分辨率(圖1e-h)。我們觀察到HBE細(xì)胞膜上只有少數(shù)Trop2,而在三種類型的NSCLC細(xì)胞膜上則有大量Trop2。此外,放大后的圖片詳細(xì)顯示了Trop2的異質(zhì)分布(圖1i-l)。
圖 1.Trop2在不同細(xì)胞系上的dSTORM成像,四種細(xì)胞膜上Trop2的TIRF圖像:(a)HBE,(b)A549,(c)H460和(d)SK-MES-1。(e–h)在這四個(gè)細(xì)胞膜上相應(yīng)的重建的Trop2的dSTORM圖像。(i-l)白色框框顯示的 Trop2 dSTORM 圖像的放大視圖。比例尺:5 μm(e–h) 和 1 μm(i–l)
2.通過(guò)SR-Tesseler方法對(duì)Trop2進(jìn)行聚類分析
除了獲得Trop2的高分辨率圖像外,使用合適的方法來(lái)定量分析蛋白質(zhì)的空間分布同樣重要。到目前為止,各種分析方法已被應(yīng)用于超分辨率成像數(shù)據(jù),例如Ripley's K函數(shù),DBSCAN (基于密度的噪聲空間聚類分析),H-SET [36](分層單發(fā)射器假設(shè)檢驗(yàn))和FOCAL (用于定位的快速優(yōu)化聚類算法)。每種算法都有自己的優(yōu)勢(shì)和應(yīng)用范圍。在這里,我們使用了一種新的圖形處理方法SR-Tesseler,它可以精確地分割定位并提取集群的信息。
圖 2. SR-Tesseler分析示意圖
(a)在HBE細(xì)胞膜上重建的Trop2的dSTORM圖像。細(xì)胞膜用紅線圈出“ROI”。(b) 閃爍校正后的 dSTORM 圖像。(c) 由許多多邊形組成的沃羅諾伊圖。(d) 對(duì)每個(gè)多邊形的局部化密度進(jìn)行閾值化提取的藍(lán)色區(qū)域(e) 提取的簇(綠色)的定位密度高于對(duì)象的平均密度。(f-h) 圖(c–e)框在中的多邊形、對(duì)象和聚類的放大圖像。比例尺:4 μm(a–e) 和 300 nm(f–h)。
3.Trop2 在原發(fā)性肺癌細(xì)胞上的顯著簇分布
為了進(jìn)一步探索和驗(yàn)證Trop2簇在原代細(xì)胞上的分布特征,我們選擇人原發(fā)性肺腺癌細(xì)胞作為NSCLC的代表,配對(duì)原代正常肺上皮細(xì)胞作為對(duì)照。與培養(yǎng)細(xì)胞一致,dSTORM圖像顯示Trop2過(guò)度表達(dá)并在肺癌細(xì)胞上形成大簇,而在正常肺細(xì)胞上存在相對(duì)較少的蛋白質(zhì)和小簇(圖3a-f)。統(tǒng)計(jì)數(shù)據(jù)表明,Trop2在癌細(xì)胞上的定位密度幾乎是正常細(xì)胞的兩倍(圖3g)。SR-Tesseler分析還證明了聚類特征的顯著差異。癌細(xì)胞上的簇面積和簇?cái)?shù)都遠(yuǎn)大于正常細(xì)胞上的簇面積和簇?cái)?shù)(圖3h-i)。此外,癌細(xì)胞具有更密集的簇,由200多個(gè)定位組成,而對(duì)于不超過(guò)100個(gè)定位的小簇,正常細(xì)胞占更大的比例(圖3j)。結(jié)果與從A549和HBE細(xì)胞獲得的結(jié)果一致。這些發(fā)現(xiàn)證實(shí)了Trop2與肺癌的腫瘤發(fā)生有關(guān),其過(guò)表達(dá)和聚集分布可能使其成為肺癌診斷的良好標(biāo)志物。
圖 3.原發(fā)性肺腺癌細(xì)胞和正常細(xì)胞上的 Trop2 分布通過(guò) dSTORM 成像顯示
(甲至乙)(a)原發(fā)性肺癌細(xì)胞和(b)正常肺細(xì)胞上的Trop2的TIRF圖像。(c–d)同一細(xì)胞膜上的相應(yīng)dSTORM圖像。(e–f)圖(c–d)白色框框的 dSTORM 圖像的放大視圖。比例尺:5 μm(c–d) 和 1 μm(e–f)。(g)Trop2在這兩種細(xì)胞上的定位密度。(h) 不同細(xì)胞膜上的團(tuán)簇標(biāo)準(zhǔn)化。(i) 每平方微米的團(tuán)簇?cái)?shù)(j) 團(tuán)簇百分比。所有結(jié)果均來(lái)自五個(gè)獨(dú)立實(shí)驗(yàn)中的十個(gè)細(xì)胞樣品。采用雙尾不配對(duì)t檢驗(yàn)處理統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。*P < 0.05,**P < 0.01,****P < 0.0001,ns 表示不顯著。
結(jié)論
綜上所述,利用STORM觀察了Trop2在NSCLC細(xì)胞和正常細(xì)胞(培養(yǎng)細(xì)胞和原代細(xì)胞)膜上的分布格局,并利用SR-Tesseler分析了其聚集特征。我們發(fā)現(xiàn)Trop2在癌細(xì)胞上的表達(dá)和聚集水平高于正常細(xì)胞,這表明Trop2在癌細(xì)胞中的過(guò)表達(dá)和聚集的共同特征,這將有助于早期癌癥診斷。盡管Trop2簇存在于所有肺癌細(xì)胞中,但值得注意的是,不同種類的癌細(xì)胞之間的團(tuán)簇性質(zhì)不同。例如,A549和H460細(xì)胞具有相對(duì)更多的簇,而SK-MES-1細(xì)胞具有與HBE細(xì)胞相似的簇?cái)?shù)。我們的研究結(jié)果為癌癥相關(guān)蛋白(如Trop2)聚集的分子機(jī)制提供了新的見(jiàn)解,并有利于開(kāi)發(fā)針對(duì)癌癥中Trop2的新藥。